截至2018年末，璧山区共有各级各类医疗卫生机构515个。其中，医院、卫生院34个、妇幼保健院1个、疾病预防控制中心1个、卫生监督所1个、私人诊所154个、卫生所（医务室）14个、村卫生室291个、门诊部7个、社区卫生服务中心（站）12个。全区共有医院、卫生院床位4909张。卫生技术人员4486人。全区执业医师和执业助理医师1656人，注册护士2229人。

　　2019年8月，入选为紧密型县域医共体建设试点县。